Snabb likvor PCR vid akut meningit/encefalit
Indikation
klinisk misstanke om akut meningit/encefalit.
Prover som lämnas före kl 17 vardagar och kl 13 helgdagar får svar samma dag. Ring och meddela (010-435 30 30) att likvor kommer att skickas för akut ”Snabb likvor PCR”!
Beställningsblankett gul A5
Ange ”Snabb likvor PCR” under kliniska data och kryssa i rutan för likvor.
Obs! Metoden kompletterar (ersätter inte!) konventionell mikrobiologisk diagnostik av CNS-infektioner. Övriga analyser ordineras och skickas till motsvarande laboratorieenhet med separat beställning enligt gällande rutiner.
Provmaterial
Likvor, cerebrospinalvätska (CSV) tagen aseptiskt via lumbalpunktion, gärna > 1 mL.
OBS metoden är inte avsedd för likvor insamlad via medicintekniska produkter, t ex shuntar.
Provtagningsmaterial
| Beskrivning | Artikelnummer | |
 |
Rör med gult skruvlock och konad botten, | 102769965 |
 |
Vacuumrör för urin, Vacuette 7/6,5 ml | 200000988 |
Transport och förvaring
Provet ska lämnas till Klinisk mikrobiologi, Laboratoriemedicin NÄL så snart som möjligt.
Efterbeställning
Analysen kan efterbeställas om provet förvaras sterilt i rumstemperatur max 1 dygn eller i kylskåpet max 7 dygn.
Mätprincip och metod
Realtids-PCR; påvisning av bakteriell, viral och kryptokockens nukleinsyra (DNA/RNA) på FilmArray multiplex meningoencefalit-panel. Testet är kvalitativt. PCR-analys kan vara aktuellt även efter insättning av antiinfektiva medel eftersom den kan påvisa förekomst av döda mikroorganismer.
Metoden är CE-märkt och IVD-godkänd men inte validerad/ackrediterad lokalt.
Meningoencefalit panel i FilmArray detekterar 6 bakteriearter, 7 virus och en jästsvamp:
| Bakterier | Virus | Jästsvamp |
| E.coli (endast kapseltyp K1) | Cytomegalovirus (CMV) | Cryptococcus neoformans/ gatti |
| Hemophilus influenzae | Human herpesvirus 6 (HHV-6) | |
| Listeria monocytogenes | Human parechovirus (HPeV) | |
| Neisseria meningitidis | Varicella zoster virus (VZV) | |
| Streptococcus agalactiae | Enterovirus (EV) | |
| Streptococcus pneumoniae | Herpes simplex virus 1 (HSV-1) | |
| Herpes simplex virus 2 (HSV-2) |
Obs! Negativt resultat utesluter inte CNS infektion. Diskussion med infektionskonsult rekommenderas för tolkning av resultat.
Interferens och felkällor
Exempel på falskt negativt resultat:
- CNS infektion med agens som inte ingår i denna panelanalys
- För tidig/sen sjukdomsskede för påvisbar arvsmassa
- Sensitiviteten är lägre vid rekurrent viral CNS infektion
- Hämmande substanser i CSV kan påverka analysen
Exempel på falskt positivt resultat:
- Provtagningskontamination
- HHV-6 förekommer i CSV ofta vid CNS infektioner av en annan etiologi
- Kvarstående nukleinsyra efter genomgången infektion (positiv 2-4
veckor efter insjuknandet)
Ackrediterad
Nej
Övrigt
Obs! CNS infektioner med vissa agens är anmälningspliktiga enligt Smittskyddslagen.