Snabb likvor PCR vid akut meningit/encefalit
Indikation
klinisk misstanke om akut meningit/encefalit.
Beställningsblankett gul A5
Ange ”Snabb likvor PCR” under kliniska data och kryssa i rutan för likvor.
Obs! Metoden kompletterar (ersätter inte!) konventionell mikrobiologisk diagnostik av CNS-infektioner. Övriga analyser ordineras och skickas till motsvarande laboratorieenhet med separat beställning enligt gällande rutiner.
Provmaterial
Likvor, cerebrospinalvätska (CSV) tagen aseptiskt via lumbalpunktion, gärna > 1 mL.
OBS metoden är inte avsedd för likvor insamlad via medicintekniska produkter, t ex shuntar.
Provtagningsmaterial
Beskrivning | Artikelnummer | |
Rör med gult skruvlock och konad botten, | 102769965 | |
Vacuumrör för urin, Vacuette 7/6,5 ml | 200000988 |
Ring Klinisk mikrobiologi, NÄL, via tel 010 435 30 30 och meddela att likvor kommer att skickas för akut ”Snabb likvor PCR”!
Transport och förvaring
Provet ska lämnas till Klinisk mikrobiologi, Laboratoriemedicin NÄL så snart som möjligt.
Frekvens
Analysen utförs dagtid alla dagar i veckan, även helger och helgdagar.
Svar
Telefonsvar inom två timmar från provets ankomst till lab, senast kl 18:00 vardagar och kl 14:00 helgdagar.
Efterbeställning
Analysen kan efterbeställas om provet förvaras sterilt i rumstemperatur max 1 dygn eller i kylskåpet max 7 dygn.
Mätprincip och metod
Realtids-PCR; påvisning av bakteriell, viral och kryptokockens nukleinsyra (DNA/RNA) på FilmArray multiplex meningoencefalit-panel. Testet är kvalitativt. PCR-analys kan vara aktuellt även efter insättning av antiinfektiva medel eftersom den kan påvisa förekomst av döda mikroorganismer.
Metoden är CE-märkt och IVD-godkänd men inte validerad/ackrediterad lokalt.
Meningoencefalit panel i FilmArray detekterar 6 bakteriearter, 7 virus och en jästsvamp:
Bakterier | Virus | Jästsvamp |
E.coli (endast kapseltyp K1) | Cytomegalovirus (CMV) | Cryptococcus neoformans/ gatti |
Hemophilus influenzae | Human herpesvirus 6 (HHV-6) | |
Listeria monocytogenes | Human parechovirus (HPeV) | |
Neisseria meningitidis | Varicella zoster virus (VZV) | |
Streptococcus agalactiae | Enterovirus (EV) | |
Streptococcus pneumoniae | Herpes simplex virus 1 (HSV-1) | |
Herpes simplex virus 2 (HSV-2) |
Obs! Negativt resultat utesluter inte CNS infektion. Diskussion med infektionskonsult rekommenderas för tolkning av resultat.
Interferens och felkällor
Exempel på falskt negativt resultat:
- CNS infektion med agens som inte ingår i denna panelanalys
- För tidig/sen sjukdomsskede för påvisbar arvsmassa
- Sensitiviteten är lägre vid rekurrent viral CNS infektion
- Hämmande substanser i CSV kan påverka analysen
Exempel på falskt positivt resultat:
- Provtagningskontamination
- HHV-6 förekommer i CSV ofta vid CNS infektioner av en annan etiologi
- Kvarstående nukleinsyra efter genomgången infektion (positiv 2-4
veckor efter insjuknandet)
Ackrediterad
Nej
Övrigt
Obs! CNS infektioner med vissa agens är anmälningspliktiga enligt Smittskyddslagen.