Bakteriell gastroenterit-PCR
Indikation
Primärdiagnostik vid bakteriell gastroenteritkolit, samt smittspårning och hälsokontroll.
I analysen ingår:
Salmonella species |
Shigella species |
EIEC (enteroinvasiv E.coli) |
EHEC (enterohemorragisk E.coli) |
ETEC (entertoxinbildande E.coli) |
Campylobacter jejuni/coli |
Yersinia enterocolitica (ej Y. pseudotuberculosis) |
Plesiomonas shigelloides |
Vibrio species |
Detta test ersätter fecesodling som primäranalys.
Fecesodling kan dock komplettera undersökningen avseende arter som inte ingår i PCR-panelen (t. ex Yersinia pseudotuberkulosis, Aeromonas mm) Därför är det viktigt att ange dem som frågeställning på beställningsblanketten.
Frekvens
Måndag till söndag, dagtid.
Beställning
Beställningsblankett gul A5:
Kryssa i rutan för Bakteriell gastroenterit-PCR.
Ange inhemsk eller utlandsförvärvad smitta med landet.
Relevanta kliniska data ex blodiga diarrér, smittspårning, insjukningsort. Övrigt: Vid stamisolering eller kontroll av bärarskap, ange bakterie.
Ange särskild frågeställning ex Aeromonas.
Assynjabeställning
F-Bakt gast PCR
Provmaterial
Feces (färsk avföring)
Rectumprov (färsk material)
Provtagningsmaterial
Provtagningsset eSwab transportmedium vit skruvkork, regular pinne, art.nr 103 605 440.
Burk med brunt skruvlock och sked, art.nr 200000942.
Provtagning
Feces
Samla upp färsk avföring på uppsamlingspapper eller toalettpapper och doppa provtagningspinnens topsdel på 4-5 ställen i avföringen. För sedan ner pinnen i eswabröret, bryt av den vid brytskåran, kasta bort den avbrutna delen och skruva noggrant på korken.
Rectum
Tänk på att patienten ska ha bajsat samma dag eller högst dagen före provtagnignen.
För in provtagningspinnens topsdel ca 2 cm i rectum och rotera pinnen noggrant. Kontrollera att det finns synlig färsk avföring på pinnen. För sedan ner pinnen i eswabröret, bryt av den vid brytskåran, kasta bort den avbrutna delen och skruva noggrant på korken.
Hållbarhet, förvaring och transport
Hållbart 2 dygn i eSwab transportmedium, med undantag för Shigella där hållbarheten är 1 dygn. Prov i fecesburk är hållbar 1 dygn.
Kylförvaring 2-8°C
Kyltransport
Svar
Svar inom 1-3 dygn.
Svarsalternativ: Bakteriell gastroenterit-PCR negativ.
Positiv besvaras: Bakterienamnet påvisad med PCR, isolering av bakterien pågår. Svar inom 1-3 dygn.
Ev odling besvaras: Växt av eller Ingen växt av, följt av bakteriens namn.
Svarstid PCR: 1-3 dygn. Svarstid odling/isolering: 1-3 dygn.
OBS!
Nyupptäckt salmonella, shigella och EHEC telefonbesvaras.
Salmonellastammar isolerade från person som har smittats eller kan ha smittats inom Sverige skickas till referenslaboratorium för typning. Svaret tar ca 1 vecka. Övriga salmonellastammar typas på begäran av provtagare som också debiteras för typningskostnaden.
Övrig information
Efter genomgången salmonellainfektion är patienten som
regel smittbärare i 1-3 månader, i enstaka fall längre. Efter shigellainfektion
är smittbärartiden i genomsnitt ca en månad.
Efter campylobacterinfektion är hälften smittfria inom två veckor, 90 % inom fem veckor.
Infektioner med salmonella, shigella, yersinia och campylobacter är anmälningspliktiga enligt smittskyddslagen.
Mätprincip
PCR (polymeras chain reaction). Analysen påvisar bakteriens DNA.
Odling utförs där PCR påvisat agens, frågeställning Aeromonas eller smittspårning mm.
Ackrediterad
Ackrediterad för Salmonella spp, Shigella/EIEC (enteroinvasiv E. coli), Campylobacter jejuni/coli, Yersinia enterocolitica och EHEC (enterohemorragisk E. coli).
Ej ackrediterad för ETEC (enterotoxigen E. coli), Vibrio spp*och Plesiomonas shigelloides.