Norovirus akut PCR

Medicinsk bakgrund

Gruppen Calicivirus består av olika grupper av Norovirus och Sapovirus. Calicivirus orsakar stora återkommande årliga epidemier i samhället, framförallt på vinterhalvåret. Calicivirus är också vanligt som smitta på sjukhus. Inte sällan måste hela sjukhusavdelningar stängas för sanering. Flera livsmedelsburna utbrott rapporteras årligen.

Norovirus finns i hela världen och kan drabba alla åldersgrupper. Virus utsöndras i mycket stora mängder främst i avföringen och det kan spridas på olika sätt:

  • via direkt eller indirekt kontakt med smittade personer, även kräkningar kan smitta,
  • via dricksvatten, via råa skaldjur eller grönsaker som förorenats med avloppsvatten
  • via livsmedel som hanterats och förorenats av en person som är eller nyligen har varit sjuk. Livsmedel utgör i detta fall en transportör av smittämne

Viruset har vid utbrott visat sig vara synnerligen smittsamt. Smittade personer kan vanligen sprida smitta upp till två dygn, ibland längre, efter symtomfrihet. Långtidsbärare av norovirus är känt. Inkubationstiden är 12-48 timmar. Symtomen är illamående, kräkningar, diarré, ibland även buksmärtor, huvudvärk, yrsel och feber. Sjukdomen är självläkande inom några dygn. Man blir inte immun och återinsjuknande är ganska vanliga.

  • PCR-analysen som utförs hos oss detekterar de två humanpatogena grupperna av Norovirus (genogrupp 1 och 2). Analysen detekterar inte sapovirus. Norovirus dominerar dock vid både samhällsförvärvad infektion och vid utbrott inom vårdinrättningar. 

Felkällor:

Ett negativt prov utesluter inte infektion. Prov kan ha tagits vid fel tidpunkt i sjukdomsförloppet med för få virus närvarande eller så kan det vara en annan släkt av calicivirus. Faeces kan innehålla inhiberande substanser, vilket leder till att resultat inte kan erhållas.


Obs! Norovirus ingår även i analysen Viral gastroenterit-PCR som detekterar norovirus, sapovirus, astrovirus rotavirus och adenovirus. Viral gastroenterit PCR analyseras dagtid och är ingen akutanalys.

Analystider

Vardagar 07:30-19:00 analyseras prover kontinuerligt. Efter det sker analys kl 21 och därefter varannan timme till kl 05.00.

Helgdagar 07.30-15.00 analyseras prover kontinuerligt. Efter det sker analys kl 18, 21 och därefter varannan timme till kl 05.00. 

OBS! Vid hög arbetsbelastning på Laboratoriemedicin kan svarstiderna förlängas!

Beställning

Beställningsblankett Klinisk mikrobiologi NÄL Uddevalla

Elektronisk ROSP

Elektronisk Assynja Visph

Information: Uppge patientens namn och personnummer samt provtagningsdatum. Ange avsändare och ev svarsmottagare och ansvarig läkares VGR-ID. Kryssa i Norovirus akut PCR och ange provmaterial, insjukningsdatum och symtom.

Provtagningsmaterial och provtagning

Feces

Kräkning

Minsta mängd 1-2 mL.

Burk med brun kork och sked

Uppsamlad feces/ kräkning förs över med skeden till röret, korken skruvas på ordentligt.

Provhantering

Hållbarhet 2 dygn Kylförvaring 2-8°C.

Transport

Kyltransport. Analysen ska ske inom 48 timmar efter insjuknande.

Svar

  • Norovirus påvisat/ Ej påvisat
  • Positiva fynd rapporteras till SME och vårdhygien

Svarstid vardagar inom 1 dygn. Övriga tider kan svarstiden vara lite längre.

Metod

PCR

Ackrediterad

Analysen är ackrediterad för feces.

Analysen är inte ackrediterad för kräkning, men erfarenhet talar dock för att Norovirus med stor säkerhet kan påvisas i kräkning med PCR-teknik.