Cerebrospinalvätska odling

Medicinsk bakgrund

De vanligast förekommande bakterierna vid purulent meningit är Streptococcus pneumoniae (52%) och Neisseria meningitidis (10%). Andel fall med Haemophilus influenzae, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, beta- och alfahemolytiska streptokocker är ungefär lika – ca 5 % för varje patogen.

Anaeroba arter förekommer vid penetrerade cerebrala infektioner (efter trauma, neurokirurgi, shunt, hjärnabscess).

I neonatalperioden förekommer även gramnegativa tarmbakterier ex Escherichia coli (E coli), Klebsiella, medan antal infektioner med Streptococcus agalactiae (GBS) minskar markant tack vare vaccination.
CNS-infektioner orsakade av Mycobacterium tuberculosis och svampar är numera sällsynta.

Prov för påvisande av bakterier i cerebrospinalvätskan tas innan
antibiotikabehandling sätts in om detta är möjligt annars får det tas så fort
som möjligt efter att antibiotika givits. Det är lämpligt att i samband med
misstanke om meningit utföra blododling samt odling från nasofarynx.

Kryptokockmeningit orsakas av en jästsvamp, Cryptococcus neoformans eller C. gatti. Frågeställningen innefattas i både odling och direktmikroskopi, som utförs på Klinisk mikrobiologi NÄL. Kryptokockantigentest har hög känslighet och utförs på Klinisk mikrobiologi SU. Dessa båda Cryptococcusarter kan påvisas även med Snabb likvor-PCR (FilmArray).

Misstanke om tuberkulös meningit, dvs odling oavseende mykobakterier (misstanke om neurotuberkulos) utförs vid Klinisk mikrobiologi, Sahlgrenska universitetssjukhuset, se länk för information. Även direktmikroskopi med frågeställning mykobakterer skickas till Klinisk mikrobiologi SU.

Indikation

Misstanke om bakteriell- eller svampmeningit (hjärnhinneinflammation), hjärn- och spinalabscess, neurokirurgiska infektioner och shuntinfektioner.

Likvorodling är avgörande för resistensbestämning och därmed adekvat behandling av svamp- och bakteriella CNS-infektioner. Metoden kan kompletteras med direktmikroskopi och PCR (t ex efter påbörjad antibiotikaterapi eller vid negativ odling).

Snabb likvor-PCR används för bredare diagnostik av svamp- virala-, bakteriella- och CNS-infektioner.

Beställning

Beställningsblankett Klinisk mikrobiologi NÄL Uddevalla

Elektronisk ROSP

Uppge patientens namn och personnummer samt provtagningsdatum. Ange avsändare och ev svarsmottagare och ansvarig läkares VGR-ID. Ange aktuell antibiotikabehandling. Kryssa i rutan CSV/likvor och för över barkodsetiketter från flaskor till beställningsblanketten. Ange obligatoriska remissuppgifter, se nedan. Kryssa i rutan för direktmikroskopi om det önskas samt telefonnummer.

Direktmikroskopi utförs under ordinarie öppettider på Klinisk mikrobiologi vid grumlig likvor eller på begäran, om tillräcklig mängd finns i röret. Direktmikroskopi utförs endast på likvor, inte från blododlingsflaska.

Obligatoriska remissuppgifter:

Vissa tillstånd kräver specifik diagnostik, anaerob odling och/eller förlängd inkubationstid och ska anges på beställningsblanketten. Det gäller misstanke om svampmeningit, ethmoidit, öppet skalltrauma, shunt/Rickhamdosa, hjärnabscess, neurokirurgiska ingrepp eller EDA/spinal anestesi.

Frågeställningen Kryptokockmeningit (svamp) anges på beställningsblanketteni rutan för kliniska data. På NÄL utförs odling, direktmikroskopi och snabb likvor-PCR, därefter skickas provet till Klinisk mikrobiologi SU för kryptokockantigentest.

OBSERVERA! Vid misstanke om tuberkulös meningit (mykobakterier) skickas provet till Klinisk mikrobiologi Sahlgrenska Universitetssjukhuset. Länk till labbutbud

Provtagningsmaterial och provtagning

CSV, cerebrospinalvätska, likvor

Sterilt rör, 10 mL gul kork

BacT/ALERT FA Plus grön

BacT/ALERT FN Plus orange

BactT/ALERT PF pPlus

Provet ska helst tas före start av antibiotikaanvändning. För allmän likvorodling ta i första hand 0,5-2 ml CSV i sterilt rör. Vid tillräcklig likvormängd är det ofta värdefullt att även spruta 0,5 mL CSV i en pediatrisk blododlingsflaska, särskilt vid längre transporttid eller under jourtid.

Tänk på att samtidigt ta blod- och de luftvägsodlingar som ingår i det diagnostiska meningitpaketet: Nasofarynx,odling svalgodling (endast för meningokocker), öronsekret vid otit och sinussekret vid sinuit.

Vid misstanke om ethmoidit,öppet skalltrauma, shunt/Rickhamdosa, hjärnabscess, neurokirurgiska ingrepp eller EDA/spinal anestesi: Spruta ner likvor i anaerob blododlingsflaska om tillräcklig provmängd finns.

Efter påbörjad antibiotikabehandling kan även 16S rRNA-analys övervägas.

Utförande: Huddesinfektion utförs med klorhexidinsprit (5mg/mL) som appliceras flödigt under c:a 1 min och därefter får lufttorka. Desinficera även flaskans gummimembran med klorhexidinsprit samt luftorkning. Släng tussarna direkt efter användning.

0,5-2 mL likvor förs över till "urinodlingsrör"

0,5 ml till pediatrisk blododlingsflaska (Gäller under jourtid eller i de fall antibiotikabehandling påbörjats).

0,5 ml (minst) till anaerob blododlingsflaska om bedömning enligt obligatoriska remissuppgifter kräver det, se ovan.

För ytterligare information se "Vårdprogram Bakteriella CNS-infektioner 2020".

Provhantering

Hållbarhet 12 timmar.

Kylförvaring 2-8°C.

Transport

Kyltransport för sterilt rör.

Blododlingsflaskor ska lämnas till Laboratoriemedicin omgående alternativt förvaras i rumstemperatur i väntan på transport.

Svar

Positiv odling telefonsbesvaras.
Resultatet av direktmikroskopi telefonbesvaras alltid.
Negativ odling 5 dygn.
Negativ svampodling 10 dygn.

Metod

Odling

Direktmikroskopi

Övrig information

Invasiva infektioner med S. pneumoniae, H. influenzae, N. meningitidis, L. monocytogenes och GAS är anmälningspliktiga enligt smittskyddslagen.